现代的爬行动物起源于古代的爬行动物，现代的鸟类起源于另一类古代的爬行动物（有始祖鸟等既像爬行动物又想鸟类的动物作为证据）；现代的哺乳动物起源不同于以上两类爬行动物的古代爬行动物。

古代的爬行动物是现代的鸟类、哺乳动物和爬行动物的祖先，而古代的爬行动物则起源于更古老的两栖动物。